Molekula - (latınca molecula, moles — kütlə sözünün kiçildici formasıdır) atomlardan ibarət mikrohissəcikdir. Materialın bütün xassələrini özündə cəmləyən ən kiçik hissəcikdir. Bəzi maddələr yalnız bir molekuladan ibarət olurlar (O2, N2, P4 və s.).
Molekulaları təşkil edən atomların quruluşunu xüsusi formula ilə ifadə edirlər. Süni yolla alınmış maddələrin molekulaları minlərlə atomdan ibarət ola bilər. Polimerlərdə ayrıca olaraq mikromolekulalardan sohbət açılır. Ancaq heç də bütün kimyəvi maddələrin hamısı molekulalardan təşkil olunmamışdırlar.
Molekulalar molekulaların quruluşu nəzəriyyəsində, kvant fizikasına əsaslanan kvant kimyasında tədqiq edilirlər.